鳜鱼是我国重要的淡水优质鱼类，也是我国渔业转方式、调结构的首选品种之一。解决鳜鱼摄食活饵养殖成本高、生长速度下降、成活率低、病害频发等问题成为鳜鱼新品种培育的重要方向。因此，利用高效的现代分子育种技术，研发创制基因芯片，对开展鳜鱼选育具有重要意义。
中国水产科学研究院珠江水产研究所鳜鲈基因组学与选择育种创新团队与华智生物技术有限公司合作，利用cGPS（Genotyping by Pinpoint Sequencing of captured targets）靶向测序技术，研发了具有自主知识产权的首个鳜鱼40K液相育种芯片“鳜芯1号”。该芯片可应用于鳜鱼种质资源鉴定、遗传多样性评估、基因定位与挖掘鉴定、全基因组关联分析、分子辅助定向改良和智能育种等不同场景，为鳜鱼遗传研究和品种选育提供了高效基因型鉴定工具。利用该芯片可筛选获得优良性状的鳜鱼新品种，还将进一步降低选育成本，助力鳜鱼全基因组选育和良种创新研究。
该芯片位点多态性高、基因组分布均匀，位点在染色体上的平均覆盖率为99.87%，平均间距17Kb。性状关联位点丰富，芯片包括团队前期研究筛选获得的鳜鱼驯食、性别和生长性状关联的分子标记554个，可用于生长、性别和驯食等重要性状的精准鉴定和挖掘利用。芯片技术参数优良，平均位点检出率为99.35%，重复样本基因型平均一致率为99.51%，与重测序样本基因型比对平均一致率为99.11%。芯片整体性能优良，稳定性好，基因型准确度高。
负责“鳜芯1号”研发的核心成员包括团队负责人孙成飞副研究员、叶星研究员、董浚键助理研究员等。更多相关讯息详见https://mp.weixin.qq.com/s/j4F_9Uufw9d7mSOGwUmzNQ。
图1 鳜鱼40K cGPS液相育种芯片检测试剂盒
图2 鳜鱼40K cGPS液相育种芯片标记位点在染色体上的分布
图3 “鳜芯1号”的检测效果
