近日，珠江水产研究所龟鳖遗传育种创新团队在濒危水生动物鼋保护遗传学方面取得进展。相关研究成果“Conservation Genetics of the Asian Giant Soft-Shelled Turtle(Pelochelys cantorii) with Novel Microsatellite Multiplexes”近期发表于国际期刊《animals》（IF2022=3.231，JCR Q1），珠江所谢敏敏硕士生、陈辰助理研究员为共同第一作者，洪孝友助理研究员和朱新平研究员为共同通讯作者。“基于微卫星标记的鼋亲子鉴定技术”发表在国内核心《水生生物学报》上，珠江所谢敏敏硕士生为第一作者，洪孝友助理研究员和朱新平研究员为共同通讯作者。该研究得到广东省青年基金面上项目(2022A1515011360)、蓝色粮仓项目(2018YFD0900201)、中国-东盟海上合作基金资助（CAMC-2018F）、中国水产科学研究院基本科研业务费专项(2020TD35)、2020-2021年佛山市院合作项目等项目的资助。
鼋(Pelochelys cantorii)是我国地区体型最大的水生龟鳖动物之一，由于人类活动，鼋在全球范围内的物种延续都面临着严酷的挑战，我国于1989年将鼋定为国家一级重点水生野生保护动物。至今，珠江所利用人工驯养保护的4只奠基鼋(2雌2雄)保育了近1000只1-8龄不同规格的子一代鼋，奠定了该物种保护的基础。
为了解子一代鼋个体的遗传信息，开展谱系管理、科学人工增殖放流，创新团队利用鼋转录组数据设计三核苷酸重复及四核苷酸重复微卫星引物3万余对，选择230对进行引物合成，经过两次筛选构建了2组多重PCR体系。比较分析了2019年和2020年产的子一代鼋的遗传多样性，10个微卫星位点多态信息含量（PIC）范围为0.313~0.674，平均值为0.401，其中2个位点具有高度多态信息含量（PIC≥0.5），显示鼋子一代群体遗传多样性处于较丰富的水平。对2021年的56个子一代个体进行亲子分析显示，10个微卫星位点的累积排除概率分别为73.14%(NE-1P)、90.98%(NE-2P)和98%(NE-3P),能够满足亲子鉴定的需要。3年的子一代遗传信息也表明4只亲本在生殖选择中表现出了明显的差异。鼋多重PCR亲子鉴定技术的建立为人工保种群体遗传结构分析、谱系管理等方面提供了有力的技术手段。
图1 基于进化树的鼋182个子一代个体间聚类图
图2 Structure分析182个体混血程度（K=2）
图3 2021年56个个体的聚类分析
